Giraud Mathieu

Thèse de doctorat

• Architectures reconfigurables pour la recherche par automates de motifs dans les séquences génomiques
  Doctorat en Informatique · 2005 · Rennes 1
  Sous la direction de Dominique Lavenier

Directions de thèse

• A dirigé la thèse de Alexandre d'Hooge (2025) — Assisting Western Popular Music Guitar Practice and Tablature Composition with Machine Learning
• A dirigé la thèse de Vanessa Nina Borsan (2024) — Melodic and Descriptor Patterns : A Computational Approach for Digitisation, Annotation, and Analysis of Slovenian Folk Song Ballads
• A dirigé la thèse de Francesco Maccarini (2024) — Modeling orchestration for computer assisted analysis and human-AI co-creativity
• A dirigé la thèse de Laurent Feisthauer (2021) — Annotation automatisée des métadonnées structurelles dans les partitions musicales : cas des modulations et des cadences pour la forme sonate
• A dirigé la thèse de Tatiana Rocher (2018) — Compression et indexation de séquences annotées
• A dirigé la thèse de Nicolas Guiomard-Kagan (2017) — Traitement de la polyphonie pour l'analyse informatique de partitions musicales
• A dirigé la thèse de Tuan Tu Tran (2012) — Comparaisons de séquences biologiques sur architecture massivement multi-coeurs
• A dirigé la thèse de Azadeh Saffarian (2011) — Algorithmes de prédiction et de recherche de multi-structures d'ARN

Publications scientifiques

• Alignment-free detection and seed-based identification of multi-loci V(D)J recombinations in Vidjil-algo
  Peer Community Journal · 2025 · avec Cyprien Borée et Mikaël Salson
• Universal Identification of Pathogenic Viruses by Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry Proteotyping
  Molecular and Cellular Proteomics · 2024 · avec Clément Lozano, Olivier Pible et Marine Eschlimann et 5 autres auteurs
• Associations between music training and the dynamics of writing music by hand
  Musicae Scientiae · 2023 · avec Aurélien Bertiaux, François Gabrielli et Florence Levé
• Standardized next-generation sequencing of immunoglobulin and T-cell receptor gene recombinations for MRD marker identification in acute lymphoblastic leukaemia; a EuroClonality-NGS validation study
  Leukemia · 2019 · avec Monika Brüggemann, Michaela Kotrova et Henrik Knecht et 34 autres auteurs
• High-throughput sequencing in acute lymphoblastic leukemia: Follow-up of minimal residual disease and emergence of new clones
  Leukemia Research · 2017 · avec Mikael Salson, Aurélie Caillault et Nathalie Grardel et 10 autres auteurs
• High-Throughput Immunogenetics for Clinical and Research Applications in Immunohematology: Potential and Challenges.
  Journal of Immunology · 2017 · avec Anton W Langerak, Monika Brüggemann et Frederic Davi et 11 autres auteurs
• Multi-loci diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia with high-throughput sequencing and bioinformatics analysis
  British Journal of Haematology · 2016 · avec Yann Ferret, Aurélie Caillault et Shéhérazade Sebda et 7 autres auteurs
• The predictive strength of next-generation sequencing MRD detection for relapse compared with current methods in childhood ALL.
  Blood · 2015 · avec Michaela Kotrova, Katerina Muzikova et Ester Mejstrikova et 11 autres auteurs
• Combined transcriptome studies identify AFF3 as a mediator of the oncogenic effects of β-catenin in adrenocortical carcinoma
  Oncogenesis · 2015 · avec Lucile Lefèvre, Hanin Omeiri et Ludivine Drougat et 10 autres auteurs
• Fast multiclonal clusterization of V(D)J recombinations from high-throughput sequencing
  BMC Genomics · 2014 · avec Mikaël Salson, Marc Duez et Céline Villenet et 6 autres auteurs

… et 18 autres publications référencées.