Berry Vincent

Thèse de doctorat

• Méthodes et algorithmes pour reconstruire les arbres de l'Evolution
  Doctorat en Mathématiques appliquées · 1997 · Montpellier 2
  Sous la direction de Olivier Gascuel

Directions de thèse

• A dirigé la thèse de Hau Nguyen Thi (2013) — Réconciliations : corriger des arbres de gènes et inférer la fiabilité d'événements évolutifs
• A dirigé la thèse de Philippe Gambette (2010) — Méthodes combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques
• A dirigé la thèse de Sylvain Guillemot (2008) — Approches combinatoires pour le consensus d'arbres et de séquences

Publications scientifiques

• Insights into the evolution, virulence and speciation of Babesia MO1 and Babesia divergens through multiomics analyses
  Emerging microbes & infections · 2024 · avec Pallavi Singh, Pratap Vydyam et Tiffany Fang et 19 autres auteurs
• On the inference of complex phylogenetic networks by Markov Chain Monte-Carlo
  PLoS Computational Biology · 2021 · avec Charles-Elie Rabier, Marnus Stoltz et Joao D. Santos et 4 autres auteurs
• Midazolam sedation in palliative medicine: retrospective study in a French center for cancer control.
  BMC Palliative Care · 2020 · avec Da Silva Arlette, Prod'Homme Chloe, Vincent Gamblin, Emmanuelle Tresch-Bruneel et Michel Reich et 2 autres auteurs
• A geography-aware reconciliation method to investigate diversification patterns in host/parasite interactions
  Molecular Ecology Resources · 2018 · avec François Chevenet, Jean-Philippe Doyon et Emmanuelle Jousselin
• Three new genome assemblies support a rapid radiation in Musa acuminata (wild banana)
  Genome Biology and Evolution · 2018 · avec Gaëtan Droc, Julie Sardos et Alberto A. Cenci et 11 autres auteurs
• Regosarc: regorafenib versus placebo in doxorubicin-refractory soft-tissue sarcoma-a quality-adjusted time without symptoms of progression or toxicity analysis
  Cancer · 2017 · avec Basson Laurent, Mir Olivier, Emilie Bogart, Jean-Yves Blay et Antoine Italiano et 11 autres auteurs
• Inferring gene duplications, transfers and losses can be done in a discrete framework
  Journal of Mathematical Biology · 2016 · avec Vincent Ranwez, Celine Scornavacca et Jean-Philippe Doyon
• SylvX: a viewer for phylogenetic tree reconciliations
  Bioinformatics · 2016 · avec François Chevenet, Jean-Philippe Doyon et Celine Scornavacca et 2 autres auteurs
• Support measures to estimate the reliability of evolutionary events predicted by reconciliation methods
  PLoS ONE · 2013 · avec Thi-Hau Nguyen, Vincent Ranwez et Celine Scornavacca
• Amalgamating Source Trees with Different Taxonomic Levels
  Systematic Biology · 2013 · avec Olaf Bininda-Emonds et Charles Semple

… et 7 autres publications référencées.