Cocherie Theophile

Publications scientifiques

• Real-world emergence of nirsevimab resistance in breakthrough infections with respiratory syncytial virus-B: a multicentre observational study in France
  The Lancet Microbe · 2026 · avec Casalegno Jean Sébastien, Zemali Nael, Derman Boris, Pargny Vincent, Petat Hortense, Guillaume Clémence, Aupiais Camille, Marot Stéphane, Perrier Marine, Faisant Anne, Cantais Aymeric, Zekre Franck, Azemar Benjamin, Francois Catherine, Becourt Arnaud, Crémadés Agathe, Baron Audrey, Ouldali Naïm, Ripley Erwan, Aubin Juliette, Vallet Sophie, Gaitan Léa et Vellas Camille et 179 autres auteurs
• Monitoring SARS-CoV-2 variants with complementary surveillance systems: risk evaluation of the Omicron JN.1 variant in France, August 2023 to January 2024
  Eurosurveillance · 2025 · avec Zemali Nael, Francois Catherine, Toyer Anne-Lise, Vallet Sophie, Adriana Traore, Kelly Charniga et Sophie Grellet et 86 autres auteurs
• Mycoplasma pneumoniae infection in adult inpatients during the 2023–24 outbreak in France (MYCADO): a national, retrospective, observational study
  The Lancet Infectious Diseases · 2025 · avec Gavaud Ariane, Holub Matthieu, Asquier Khati Antoine, Goehringer François, Luque Paz David, Arnould Bérangère, Gerber Victor, Declerck Charles, Gazaignes Sandrine, Loubet Paul, Mrozek Natacha, Cresta Mélanie, Mailhe Morgane, Bleibtreu Alexandre, Palich Romain, Poitrenaud Delphine, Federici Laura, Merlet Audrey, Abid Salma, Basille Damien, Dubee Vincent, Jaubert Paul, Vignes Dorothee, Boukraa Amine, Corti Léonard, Dubert Marie, Clapin Sixtine, Wemmert Charlotte, De Monteynard Soline, Delagrèverie Héloïse, Vinclair Camille, Hamon Antoine, Bohard Louis, Anxionnat Raphaël, Oliosi Emma, Baltes Virginie, Lo Stéphane, Thy Michael, Lioger Bertrand, Vial Guillaume, Barthod Laure, Puges Mathilde, Gensous Noémie, Rolland Simon, Fedun Yannick, Barsi Pierre, d'Arco Laurent, Lorleac'h Aurélien, Deshayes Samuel, Catherine François-Xavier, Martineau Delphine, Berthomier Marie, Lachatre Marie, Roché Nicolas, Lemmet Thomas, Wolf Mathilde, Lecapitaine Anne-Lise, Smati Mounira, Cheminet Melinda, Devloo Cécile, Membrey Benjamin, Declercq Pierre-Louis, Avenel Marine, Gatey Caroline, Curie Alexandre, Bellefleur Marie, Pourbaix Annabelle, Goyard Céline, Cabras Ornella, Bigeard Bastien, Ronin Vincent, Quenard Fanny, El Zeenni Nastasia, Garneret Etienne, Cattelan Jessy, Delfino Marie, Vollmer Olivier, Houist Anne-Laure, Chezel Julie, Molliere Chloé, Schmidt Julien, Gilardin Laurent, Munier Anne-Lise, Brodeur Sarah, Vuotto Fanny, Lambert Marc, Titecat Marie, Andre Loic, Grouteau Gaspard, Alik Simon, Dermit Marie, Lansalot-Matras Pauline, Pellerin Sarah, Franchi Victor, Oudeville Pierre, Kaeuffer Charlotte, Henard Sandrine, Ramsamy Natesan, Valentin Simon, Gaborit Benjamin, Blanc Francois-Xavier, Delaunay Clarisse, Roger Camille, Larcher Romaric, Chiaruzzi Myriam, Villa Fanny, Lehoux Mélanie, Pavin Claire, Gounelle Louis, Destoop Justin, Danjou William, Berot Vincent, Pouderoux Cécile, Boussouar Samia, Martellosio Jean-Philippe, Laurent Steven, Jaffal Karim, Dahmane Lotfi, Picard Léa, Diallo Kevin, Manaquin Rodolphe, Koumar Yatrika, Andry Fanny, Bounhiol Agathe, Belan Martin, Desvergez Arnaud, Kienlen Aurélie, Lesourd Anaïs, Gobert Delphine, Valayer Simon, Dollat Marion, Billy Pierre-Alain, Saunier Florian, Mellon Guillaume, Danion François, Le Hyaric Coralie, Decours Pauline, Menard Céline, Maitre Thomas, Beaudequin Nausicaa, Viguier Clément, Balen Frédéric, Dureault Amelie, Durand Hélène, Coutier Fabrice, Grandperrin Mathilde, Hermet Marion, Valdes Audrey, Caraux Pauline et Gourbeyre-Masson Kévin et 209 autres auteurs
• Relationships between oral microbiome and head and neck squamous cell carcinoma: a systematic review
  Oral Oncology · 2025 · avec Le Guevelou Jennifer, Larnaudie Audrey, Perazzi Mathias, El Houat Yasmine, Bastit Vianney, Pointreau Yoann et Marie-Christine Béné et 1 autre auteur
• Genotypic and phenotypic characterisation of respiratory syncytial virus after nirsevimab breakthrough infections: a large, multicentre, observational, real-world study
  The Lancet Infectious Diseases · 2025 · avec Casalegno Jean Sébastien, Marot Stéphane, Zemali Nael, Francois Catherine, Derman Boris, Pargny Vincent, Petat Hortense, Guillaume Clémence, Aupiais Camille, Perrier Marine, Faisant Anne, Cantais Aymeric, Zekre Franck, Azemar Benjamin, Becourt Arnaud, Domitien Léa, Crémadés Agathe, Ouldali Naïm, Prot Matthieu, Vallet Sophie, Gaitan Léa et Vellas Camille et 165 autres auteurs
• Genotypic and phenotypic characterisation of respiratory syncytial virus after nirsevimab breakthrough infections: a large, multicentre, observational, real-world study
  The Lancet Infectious Diseases · 2024 · avec Casalegno Jean Sébastien, Marot Stéphane, Zemali Nael, Francois Catherine, Derman Boris, Pargny Vincent, Petat Hortense, Guillaume Clémence, Aupiais Camille, Perrier Marine, Faisant Anne, Cantais Aymeric, Zekre Franck, Azemar Benjamin, Becourt Arnaud, Domitien Léa, Crémadés Agathe, Ouldali Naïm, Prot Matthieu, Vallet Sophie, Gaitan Léa et Vellas Camille et 163 autres auteurs
• Performance of whole genome sequencing for respiratory syncytial virus: insights from the first external quality assessment, France, 2024
  Clinical Microbiology and Infection · 2024 · avec Casalegno Jean Sébastien, Zemali Nael, Marot Stéphane, Toyer Anne-Lise, Vellas Camille, Alice Moisan, Hadrien Regue et Yannis Rahou et 69 autres auteurs
• Prevalence and risk factors of anal human papillomavirus infections among men having sex with men and transgender women in Phnom Penh, Cambodia
  Journal of Infection · 2023 · avec Marot Stéphane, Aude Jary, Sokleaph Cheng et Gervillien Arnold Malonga et 6 autres auteurs
• Comparative Performance of Anyplex II HPV28 and Cobas 4800 Human Papillomavirus (HPV) Assays for High-Risk HPV Detection in Self-collected Anal Samples
  Open Forum Infectious Diseases · 2023 · avec Marot Stéphane, Gauthier Delvallez, Sokleaph Cheng et Gervillien Arnold Malonga et 6 autres auteurs
• French national epidemiology of bacterial superinfections in ventilator-associated pneumonia in patients infected with COVID-19: the COVAP study
  Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials · 2023 · avec Pichon Maxime, Anglade Florence, Delbove Agathe, Dumont Yann, Ferre Alexis, François Juliette, Gachet Clémence, Geslain Guillaume, Goury Antoine, Gyde Esther, Le Breton Elodie, Lessard Pauline, Michaud Anthony, Paluch Maxime, Quesnel Kevin, Saint-Sardos Pierre, Tran Quy Antoine et Vinclair Camille et 98 autres auteurs

… et 4 autres publications référencées.