Enaud Raphaël

Thèse de doctorat

• Microbiome et inflammation pulmonaires et digestifs dans la mucoviscidose : Approches physiopathologiques et thérapeutiques
  Doctorat en Microbiologie - immunologie · 2021 · Bordeaux
  Sous la direction de Michael John Fayon

Publications scientifiques

• Changes in the fungal ecology in the era of CFTR modulators: Results from a French multicentre study focused on cystic fibrosis airways
  Medical Mycology · 2026 · avec Lefranc Maxime, Herault Etienne, Vallet Sophie, Anne-Pauline Bellanger, Hélène Guegan et Sébastien Imbert et 8 autres auteurs
• Effect of elexacaftor–tezacaftor–ivacaftor on bronchial dilatations in adolescents with cystic fibrosis: a multicentre prospective observational study
  The Lancet Respiratory Medicine · 2026 · avec Arnouat Baptiste, Barillon Jeanne, Barzic Audrey, Benhamida Myriam, Cisterne Camille, Cosson Laure, Dournes Gael, Gachelin Elsa, Giraud Charlotte, Herzog Audrey, Delval Antoine, Hutt Antoine, Jamin Marie, Kiefer Sébastien, Labbe Guillaume, Ladaurade Alice, Lenoir Marion, Livrozet Clotilde, Marchal Sarah, Mayer Sophie, Morel Baptiste, Ohlmann Camille, Petit Isabelle, Pezron Juliette, Pouradier Delphine, Revillion Marine, Roditis Léa, Sauvage Floriane, Simon Sophie, Thouvenin Guillaume et Vallois Sophie et 101 autres auteurs
• A nationwide experience of biological treatments in children with eosinophilic esophagitis
  Pediatric Research · 2025 · avec Soudant Juliette, Lejeune Stéphanie, Caron Nicolas, Butori Mathilde, Madeleine Aumar, Hélène Lengline et Cyrille Hoarau et 11 autres auteurs
• Machine Learning for Compositional Microbiome Data to Predict a Clinical Outcome: Are Interpretable Methods Up to the Task?
  2025 · avec Céline Hosteins, Marta Avalos et Diego Kauer et 2 autres auteurs
• Predicting Response to Cystic Fibrosis Modulators from Compositional Microbiome Data: A Comparison of Adapted Machine Learning Approaches
  2025 · avec Céline Hosteins, Marta Avalos et Diego Kauer et 1 autre auteur
• Mixed effects models for longitudinal compositional data using the SAEM algorithm: Application to identifying respiratory microbiome-based predictive
  2025 · avec John Barrera, Cristian Meza et Marta Avalos et 3 autres auteurs
• Clinical and bronchial parameters associated with the exacerbation frequency of severe preschool wheezers
  Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice · 2024 · avec Beaufils Fabien, Prevel Renaud, Henrot Pauline, Michelet Marine, Siao Him Fa Valerie, Pauline Esteves, Marilyne Campagnac et Elise Maurat et 24 autres auteurs
• Challenges of Microbiome Data Analysis in Chronic Respiratory Disease Studies: Examples from Three French Studies
  2024 · avec Marta Avalos, John Barrera et Cristian Meza et 3 autres auteurs
• Risk factors for surgery in stricturing small bowel Crohn's disease: A retrospective cohort study from the GETAID pédiatrique
  Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition · 2024 · avec Lacotte Edouard, Boujonnier Louis, Lerisson Héloïse, Comte Aurélie, Bertrand Valerie, Caron Nicolas, Breton Anne et Duclaux Loras Rémi et 11 autres auteurs
• Effects of Lumacaftor-Ivacaftor on Airway Microbiota-Mycobiota and Inflammation in Patients with Cystic Fibrosis Appear To Be Linked to Pseudomonas aeruginosa Chronic Colonization
  Microbiology Spectrum · 2023 · avec Florian Lussac-Sorton, Elena Charpentier et Lourdes Velo-Suárez et 8 autres auteurs

… et 24 autres publications référencées.