Choisir son sujet de thèse : par où commencer ?
Partir d’une question plutôt que d’un thème, vérifier données, cadre réglementaire, temps et encadrement — et ce que font les thèses récentes, d’après 9 000 résumés déposés sur DUMAS.
Par Simon Robain, créateur de Supermédecin. Publié le 27 septembre 2026. Sources vérifiées le 27 septembre 2026. Lecture : 9 min.
Choisir un sujet de thèse, ce n’est pas trouver une idée originale : c’est trouver une question à laquelle vous pourrez répondre, avec les données, l’encadrement et le temps dont vous disposez réellement. Cette page aide à trier les idées avant de s’y engager, et se termine par une fiche de cadrage à remplir.
Les règles nationales citées ont été vérifiées à la date indiquée en bas de page. Direction de thèse, validation du sujet, composition du jury : l’essentiel se décide dans chaque faculté, et les exemples donnés ici sont datés. Le calendrier, lui, a son propre guide : Organiser sa thèse pendant l’internat.
La réponse courte
- Le sujet se choisit tôt : au plus tard avant la fin du deuxième semestre validé de la phase d’approfondissement. Il est approuvé par le coordonnateur local de votre spécialité et figure dans votre contrat de formation.
- Partez d’une question précise, pas d’un thème. Puis vérifiez quatre points avant de vous y attacher : les données, le cadre réglementaire, le temps, l’encadrement.
- La méthode pèse autant que le sujet. En médecine générale, les thèses récentes sont le plus souvent qualitatives ; dans les autres spécialités, ce sont des études rétrospectives sur dossiers.
- Qui peut diriger, quelles validations s’ajoutent à celle du coordonnateur, combien de membres au jury : les règles changent d’une faculté à l’autre. Pour les règles locales, la page de votre département ou de votre bureau des thèses fait foi.
Ce que fixent les textes, et ce qu’ils laissent aux facultés
La thèse d’exercice « se réfère à la spécialité suivie et porte sur un travail de recherche ». Au niveau national, trois règles encadrent le sujet :
- il est approuvé par le coordonnateur local de votre spécialité ;
- il est inscrit dans votre contrat de formation, établi pendant la phase socle ;
- il est choisi au plus tard avant la fin du deuxième semestre validé de la phase d’approfondissement.
Le jury compte au moins trois membres ; il est présidé par un professeur des universités titulaire des disciplines médicales, désigné par le président de l’université. En médecine générale, les enseignants associés de la discipline peuvent y siéger, mais pas le présider.
Les textes nationaux ne disent rien du directeur de thèse. Chaque faculté fixe ses règles, et elles divergent :
| Faculté | Qui peut diriger | Exemple d’exigence locale |
|---|---|---|
| Paris Cité, médecine générale | Tout médecin thésé | Avis favorable de la commission de thèse avant tout projet |
| Lille | Un titulaire d’un doctorat en santé ou d’un doctorat d’université, pas forcément enseignant ; pas un docteur junior | Jury de quatre membres en règle générale, trois tolérés dans les disciplines sous tension, comme la médecine générale ou la psychiatrie |
| Lyon, médecine générale | Pas nécessairement un médecin, ni un docteur | Validation de la fiche de thèse obligatoire avant le recueil des données |
La thèse à deux n’est pas partout possible non plus : Lyon accepte, sous conditions, une thèse rédigée par deux candidats au plus ; Lille la conçoit comme un travail individuel.
Ce que font les thèses récentes
Méthode principale des thèses d’exercice soutenues de 2022 à 2025 et déposées sur DUMAS, d’après leur titre et leur résumé.
| Méthode | Médecine générale | Autres spécialités |
|---|---|---|
| Étude qualitative par entretiens ou groupes | environ 40 % | moins de 5 % |
| Enquête par questionnaire | environ 25 % | environ 5 % |
| Étude rétrospective sur dossiers | environ 10 % | près de la moitié |
| Étude prospective ou de cohorte | moins de 10 % | environ 15 % |
| Revue de la littérature | moins de 10 % | moins de 10 % |
| Essai contrôlé | environ 1 % | environ 5 % |
| Consensus d’experts | environ 1 % | moins de 1 % |
Les deux groupes ne posent pas les mêmes questions. La médecine générale interroge souvent des pratiques, des représentations, des parcours : les entretiens y répondent. Les autres spécialités, surtout hospitalières, disposent de dossiers structurés : l’étude rétrospective s’y prête.
Aucune n’est une méthode facile. Une étude qualitative demande de recruter, de conduire et de retranscrire des entretiens, puis de les analyser avec rigueur. Une étude rétrospective demande l’accès aux dossiers, un recueil minutieux et des démarches de protection des données. Choisissez la méthode que votre question exige et que votre directeur maîtrise, pas celle qui paraît la plus rapide.
Méthode. Source : les thèses d’exercice de médecine soutenues de 2022 à 2025 et déposées avec un résumé sur DUMAS, l’archive ouverte des thèses et mémoires hébergée par HAL, interrogée le 27 septembre 2026 : 9 134 thèses, dont 3 969 en médecine générale et 5 165 dans les autres spécialités ; 1 188 thèses sans discipline renseignée sont écartées. La méthode principale est repérée par des mots-clés dans le titre et le résumé, et le repérage a été contrôlé à la main sur un échantillon. Quand plusieurs méthodes sont citées, la revue de la littérature l’emporte, ce qui en majore un peu la part. Environ une thèse sur dix en médecine générale et une sur six ailleurs n’est pas classée, d’où des ordres de grandeur arrondis. Le dépôt sur DUMAS dépend de chaque université : ce n’est pas un recensement national.
Partir d’une question, pas d’un thème
« Le diabète en médecine générale » est un thème. « Qu’est-ce qui empêche les patients diabétiques suivis dans une maison de santé de faire leur examen du fond d’œil annuel ? » est une question. La différence n’est pas de style : seule la seconde dit qui vous allez étudier, ce que vous cherchez, et donc quelle méthode employer.
Les questions les plus solides viennent souvent du terrain : une situation de stage qui vous a surpris, une pratique qui varie d’un maître de stage à l’autre, une consigne que personne ne sait justifier. Votre futur directeur a peut-être aussi des questions en attente. Et certaines facultés publient les fiches de thèse déjà validées : Lyon, par exemple, tient la liste de celles de son collège de médecine générale depuis 2014.
Vérifiez que la question n’a pas déjà été traitée. theses.fr ne recense pas les thèses d’exercice, seulement les doctorats. Cherchez dans :
- le SUDOC, le catalogue des bibliothèques universitaires, où une thèse d’exercice porte cette mention dans sa note de thèse — son signalement n’y est pas obligatoire non plus ;
- DUMAS, en sachant que chaque université choisit ce qu’elle y dépose ;
- le dépôt de votre université quand elle en a un propre — Lille, par exemple, dépose sur PEPITE ;
- PubMed et LiSSa, la base d’articles de santé en français, pour la littérature publiée.
Une question déjà posée n’est pas disqualifiée : la reprendre dans une autre population ou un autre territoire peut avoir du sens. Mais il faut le savoir avant de commencer, et pouvoir le justifier.
Quatre vérifications avant de s’attacher à une question
Les données. Existent-elles ? Sont-elles accessibles, à qui faut-il les demander, et en combien de temps ? Pour une étude sur dossiers, qui autorise l’extraction ? Pour des entretiens, pourrez-vous recruter assez de participants ?
Le cadre réglementaire. Il dépend de ce que vous faites et auprès de qui. Les cas les plus fréquents :
| Votre projet | Cadre | Ce qu’il implique |
|---|---|---|
| Questionnaire ou entretiens auprès de professionnels de santé sur leurs pratiques | Hors recherche impliquant la personne humaine | Protection des données avec le délégué de votre université ; un avis de comité d’éthique est souvent demandé pour publier |
| Réutilisation de données existantes, par exemple des dossiers | Recherche n’impliquant pas la personne humaine | Méthodologie de référence MR-004 de la CNIL, déclarée par l’établissement responsable : inscription au répertoire public de la Plateforme des données de santé, analyse d’impact, information des personnes ; à défaut de conformité, autorisation de la CNIL. Certaines études internes à un service en sont dispensées : à faire confirmer par le délégué à la protection des données |
| Entretiens, observations ou questionnaires auprès de patients, sans modifier leur prise en charge | Selon la finalité : recherche impliquant la personne humaine de catégorie 3 si le projet vise les connaissances médicales ; hors de ce cadre s’il relève des sciences humaines et sociales ou d’une enquête de satisfaction | Catégorie 3 : un promoteur, l’avis favorable d’un comité de protection des personnes tiré au sort, la méthodologie MR-003 ; sinon, protection des données et souvent un comité d’éthique |
| Intervention sur les patients | Recherche impliquant la personne humaine de catégorie 1 ou 2 | Promoteur, comité de protection des personnes et, pour la catégorie 1, autorisation de l’autorité compétente |
La frontière entre ces cas dépend de la finalité exacte du projet. Faites qualifier le vôtre par la structure de votre université — délégué à la protection des données, cellule d’appui à la recherche, département — avant d’écrire la première question. À Lyon, le collège de médecine générale demande de modifier un projet relevant de la recherche impliquant la personne humaine si l’interne n’est pas accompagné par un chercheur professionnel adossé à un laboratoire de recherche.
Le temps. Mettez la question face à votre date limite de soutenance, qui dépend de votre spécialité et de votre promotion : le guide sur l’organisation de la thèse la donne pour chaque cas. Un avis de comité, un recrutement lent ou un recueil sur un an entier peuvent rendre une bonne question impossible dans votre calendrier.
L’encadrement. Un directeur disponible vaut mieux qu’un directeur prestigieux. Demandez-lui combien de thèses il dirige en même temps, dans quel délai il relit, s’il connaît la méthode envisagée et qui fera quoi — recrutement, analyse, relecture.
La fiche de cadrage
À remplir avant de demander la validation du sujet, puis à relire avec votre directeur.
| Rubrique | Votre réponse |
|---|---|
| La question, en une phrase | |
| La population étudiée | |
| La méthode, et pourquoi elle répond à la question | |
| Les données : où, qui les détient, qui autorise | |
| Le cadre réglementaire, et qui l’a confirmé | |
| Le directeur, et ce qu’il prend en charge | |
| La validation locale : commission, coordonnateur, fiche à déposer | |
| La date limite de soutenance | |
| La durée estimée de chaque étape | |
| Ce qui ferait échouer le projet, et le plan de repli |
Si une case reste vide après une semaine, c’est une information : elle désigne ce qu’il faut éclaircir en premier.
Ce que cette page ne fait pas
Elle ne choisit pas de sujet à votre place et ne classe pas les méthodes. Elle ne qualifie pas juridiquement votre projet : c’est le rôle des structures compétentes — celles de votre université, puis, s’il y a lieu, le comité de protection des personnes. Et elle ne remplace pas votre département ou votre bureau des thèses, dont les règles locales priment sur les exemples donnés ici.
La suite
Planifier sa thèse à reboursSources
- Article R632-23 du code de l’éducation (version en vigueur depuis le 10 novembre 2025) — la thèse « se réfère à la spécialité suivie et porte sur un travail de recherche » ; elle est soutenue avant la fin de la phase d’approfondissement, sauf dérogation exceptionnelle du président de l’université pour un motif dûment justifié — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Arrêté du 12 avril 2017 portant organisation du troisième cycle des études de médecine — art. 13 (contrat de formation comprenant le sujet de thèse), art. 42, 59, 62 et 63 (thèse, phase de consolidation, année de thèse), art. 60 (sujet approuvé par le coordonnateur local, choisi avant la fin du deuxième semestre validé de la phase 2, jury d’au moins trois membres) — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article L1121-1 du code de la santé publique — les trois catégories de recherches impliquant la personne humaine et l’obligation d’un promoteur — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article L1121-4 du code de la santé publique — avis favorable d’un comité de protection des personnes, et autorisation de l’autorité compétente pour la catégorie 1 — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article R1121-1 du code de la santé publique — ne sont pas des recherches impliquant la personne humaine, notamment, celles qui évaluent les modalités d’exercice des professionnels de santé (II 2°), les enquêtes de satisfaction et les expérimentations en sciences humaines et sociales dans le domaine de la santé (II 1°) — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Arrêté du 12 avril 2018 fixant la liste des recherches mentionnées au 3° de l’article L1121-1 — annexe : entretiens, observations, tests et questionnaires relevant de la catégorie 3 — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Recherches dans le domaine de la santé : quelles formalités ? (22 mai 2024) — MR-001, MR-003, MR-004 — CNIL, consulté le 27 septembre 2026.
- Méthodologie de référence MR-004 — recherches n’impliquant pas la personne humaine : répertoire public de la Plateforme des données de santé, analyse d’impact, information des personnes — CNIL, consulté le 27 septembre 2026.
- Pourquoi ma thèse n’est-elle pas présente sur theses.fr ? — theses.fr ne signale « ni les HDRs, ni les thèses d’exercices » — ABES, consulté le 27 septembre 2026.
- Thèses d’exercice — signalement non obligatoire, au choix de chaque établissement, dans le SUDOC — ABES, consulté le 27 septembre 2026.
- LiSSa, littérature scientifique en santé — base bibliographique d’articles en français — CISMeF, CHU de Rouen, consulté le 27 septembre 2026.
- DUMAS, archive ouverte des mémoires et thèses d’exercice — métadonnées des thèses d’exercice de médecine interrogées par l’API de HAL (type de diplôme, date de soutenance, faculté, discipline, titre, résumé) — CCSD (HAL), consulté le 27 septembre 2026.
- Être directeur de thèse — « tout médecin thésé peut être directeur » — Département de médecine générale, Université Paris Cité, consulté le 27 septembre 2026.
- Fiche de thèse — avis favorable de la commission de thèse requis avant tout projet — Département de médecine générale, Université Paris Cité, consulté le 27 septembre 2026.
- Instructions relatives aux thèses d’exercice de médecine (11 juillet 2025) — directeur, jury, réservation plus de trois mois avant, pièces au moins quatre semaines avant, dépôt sur PEPITE ; juin, septembre et octobre à éviter — Université de Lille, UFR3S, consulté le 27 septembre 2026.
- Thèse de médecine, spécialité médecine générale — directeur non nécessairement médecin ni docteur, validation de la fiche avant le recueil, projets relevant de la recherche impliquant la personne humaine, liste des fiches validées depuis 2014 — Collège universitaire de médecine générale, Université Lyon 1, consulté le 27 septembre 2026.
- Procédure de soutenance de thèse de médecine 2026 (23 avril 2026) — dossier quatre semaines avant, fermetures de décembre et d’août, thèse à deux candidats au plus — Université Claude Bernard Lyon 1, consulté le 27 septembre 2026.
- Article L1123-6 du code de la santé publique — le comité de protection des personnes est désigné de manière aléatoire — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Règles de catalogage des thèses hors doctorat — mention « Thèse d’exercice » dans la note de thèse du SUDOC — ABES, consulté le 27 septembre 2026.
- Déclaration à la CNIL, CPP et comité d’éthique — avis d’un comité d’éthique de la recherche recommandé pour publier — Département de médecine générale, Université Paris Cité, consulté le 27 septembre 2026.
À lire ensuite
- Organiser sa thèse pendant l’internat : un rétroplanning réalisteLa date limite de soutenance selon votre spécialité et votre promotion, ce qu’ont fait vos aînés d’après les archives de thèses, et un rétroplanning à adapter.
- Premier semestre d’internat : préparer son arrivéeLes démarches à faire avant de prendre ses fonctions, les interlocuteurs à identifier et les questions à poser les premiers jours. Organisation, pas protocole de soin.