Organiser sa thèse pendant l’internat : un rétroplanning réaliste

Une thèse d’exercice se planifie à l’envers : on part de la date à laquelle elle doit être soutenue, et on remonte. Cette date, ce sont les textes qui la fixent — et pour les internes de médecine générale, elle a beaucoup avancé. Cette page donne l’échéance selon votre situation, ce que les internes des promotions précédentes ont fait dans les faits, les étapes qui ne dépendent pas de vous, et un rétroplanning à adapter.

La réponse courte

• La règle générale est de soutenir avant la fin de la phase d’approfondissement. C’est une condition pour entrer en phase de consolidation et devenir docteur junior — sauf, en médecine générale, pour les promotions 2023 à 2025 dont l’université a prolongé le délai.
• En médecine générale, le délai de trois ans après le DES a disparu pour les internes entrés depuis 2023. Sous l’ancienne règle, un sur cinq seulement soutenait pendant ses trois années d’internat.
• Ailleurs, la règle actuelle s’applique depuis 2017 : dans les promotions 2017 à 2019 retrouvées sur DUMAS, six thèses sur dix ont été soutenues dans les quatre mois précédant l’échéance.
• Les délais qui ne dépendent pas de vous — validation du sujet, avis d’un comité, réservation de salle, dépôt au moins quatre semaines avant — se comptent en mois. Ils se planifient en premier.

Votre date limite

En médecine générale, la phase d’approfondissement dure quatre semestres, après les deux de la phase socle : elle se termine à la fin de la troisième année, sauf si vous suivez une formation spécialisée transversale, qui la prolonge d’un an.

La prolongation des promotions 2023 à 2025 n’est pas un droit individuel. Le décret du 6 novembre 2025 la réserve aux universités qui rencontrent des difficultés matérielles pour organiser les soutenances, compte tenu du nombre de candidats. Le président de l’université la décide, sur proposition du directeur de l’UFR, et elle vaut alors pour tous les internes de médecine générale de cette UFR. Demandez à votre faculté, par écrit, si elle l’a adoptée. Dans une faculté qui l’a adoptée, les internes concernés sont nommés docteurs juniors sur la seule validation de la phase d’approfondissement, et soutiennent pendant la phase de consolidation.

Une dérogation individuelle existe, mais elle est exceptionnelle. Le président de l’université peut l’accorder, sur proposition du directeur de l’UFR, pour un motif dûment justifié. Elle ne se planifie pas.

Ne pas avoir soutenu à temps a des conséquences en chaîne. Sans thèse, pas de diplôme d’État de docteur, donc pas de phase de consolidation, hors prolongation accordée aux promotions 2023 à 2025 de médecine générale. L’interne qui a validé sa phase d’approfondissement sans avoir soutenu s’inscrit en « année de thèse ». Dans les spécialités où les stages de phase de consolidation se choisissent une fois par an, celui qui n’a pas soutenu avant le semestre de novembre participe à une nouvelle procédure de choix, au titre du semestre de mai. Et une autorisation de remplacement ne peut plus être délivrée au-delà de trois ans après la durée normale de votre DES, sauf report de soutenance attesté par votre UFR.

Ce que les internes ont fait, dans les faits

Délai entre l’entrée en internat — le 1er novembre de l’année de la promotion — et la soutenance, pour les thèses retrouvées dans l’archive DUMAS.

En médecine générale, l’ancienne règle a produit des soutenances tardives. Un an après la fin de leur DES de trois ans, la moitié des internes n’avaient pas encore soutenu. Neuf sur dix le faisaient avant six ans, le plafond de l’époque. Pour les internes entrés depuis 2023, la règle devient, hors prolongation, ce que faisait un sur cinq de leurs prédécesseurs — à peine plus d’un sur dix dans les promotions 2017 et 2018 : soutenir avant la fin de la troisième année. Le calendrier de vos aînés n’est donc plus un modèle.

Hors médecine générale, les promotions de la réforme de 2017 ont soutenu environ huit mois et demi plus tôt. La règle a aussi resserré les soutenances contre l’échéance : dans les promotions 2017 à 2019, six thèses sur dix ont été soutenues entre juillet et octobre de la troisième ou de la quatrième année d’internat, juste avant le changement de phase de novembre. À ce stade, un retard de quelques semaines retarde l’entrée en phase de consolidation.

Les étapes qui ne dépendent pas de vous

Une thèse, c’est surtout du travail personnel. Mais plusieurs étapes attendent la décision de quelqu’un d’autre, et ce sont elles qui font glisser les calendriers.

La validation du sujet. Au niveau national, le sujet est approuvé par le coordonnateur local de votre spécialité, inscrit dans votre contrat de formation, et choisi au plus tard avant la fin du deuxième semestre validé de la phase d’approfondissement. Des facultés ajoutent une étape. À Paris Cité, en médecine générale, l’avis favorable de la commission de thèse est requis avant tout projet. À Lyon, la validation de la fiche de thèse est obligatoire avant le recueil des données.

Les démarches réglementaires. Elles dépendent de votre projet, et le guide sur le choix du sujet aide à savoir lesquelles s’appliquent. Deux ordres de grandeur :

• un comité de protection des personnes, pour une recherche impliquant la personne humaine, rend son avis dans les 45 jours qui suivent la notification d’un dossier complet, et dans les 60 jours s’il pose des questions — le délai étant suspendu le temps des réponses du promoteur. Son silence vaut rejet ;
• un comité d’éthique de la recherche, souvent demandé pour publier même quand la loi ne l’impose pas, répond en général en trois mois selon le département de médecine générale de Paris Cité.

Le jury et la salle. La composition du jury se fait avec le directeur et selon les règles locales. La réservation de salle peut être le vrai goulot : Lille, qui organise plus de 550 soutenances par an, recommande de réserver plus de trois mois à l’avance, et déconseille juin, septembre et octobre, périodes surchargées.

Le dépôt. Paris Cité, Lyon et Lille demandent le dossier complet ou le manuscrit au moins quatre semaines avant la soutenance, avec parfois un contrôle anti-plagiat. À Lyon, les fermetures de décembre et d’août ne comptent pas dans ces quatre semaines : pour soutenir entre le 1er et le 5 septembre, le dossier doit être déposé avant le 20 juillet ; Paris Cité fixe le 23 juillet pour début septembre.

Un rétroplanning, à adapter

Deux remarques sur cet exemple. D’abord, le travail lui-même ne commence vraiment qu’une fois le sujet validé : le département de médecine générale de Besançon parle de 12 à 18 mois de travail en moyenne, ce que le tableau respecte. Ensuite, la marge n’est pas du temps libre : c’est ce qui absorbe un avis de comité plus long que prévu, un recrutement difficile ou un stage épuisant.

Dans une autre spécialité, le squelette est le même. Seule change la date de fin de la phase d’approfondissement, qui dépend de votre maquette et, le cas échéant, d’une option ou d’une formation spécialisée transversale : lisez-les avant de fixer quoi que ce soit.

Le point mensuel

Dix minutes par mois, avec le rétroplanning sous les yeux :

1. Quelle étape devait être terminée ce mois-ci, et l’est-elle ?
2. Qu’est-ce que j’attends de quelqu’un d’autre, et depuis quand ?
3. Mon directeur a-t-il eu de mes nouvelles ce mois-ci ?
4. Que me reste-t-il de marge avant la date limite ?
5. Mon prochain stage me laissera-t-il le temps prévu ?
6. Faut-il avancer une réservation ou une demande dès maintenant ?

Si votre marge diminue deux mois de suite, le calendrier n’est plus réaliste : c’est le moment d’en parler au directeur, pas à la veille du dépôt.

Ce que cette page ne fait pas

Elle ne remplace ni votre faculté, ni votre département de médecine générale, ni votre coordonnateur : ce sont eux qui fixent les étapes et les délais locaux, et eux seuls qui peuvent vous répondre sur votre cas. Les chiffres décrivent ce qu’ont fait les promotions précédentes, dans les universités qui déposent sur DUMAS ; ils ne prédisent pas votre calendrier.