Organiser sa thèse pendant l’internat : un rétroplanning réaliste
La date limite de soutenance selon votre spécialité et votre promotion, ce qu’ont fait vos aînés d’après les archives de thèses, et un rétroplanning à adapter.
Par Simon Robain, créateur de Supermédecin. Publié le 27 septembre 2026. Sources vérifiées le 27 septembre 2026. Lecture : 10 min.
Une thèse d’exercice se planifie à l’envers : on part de la date à laquelle elle doit être soutenue, et on remonte. Cette date, ce sont les textes qui la fixent — et pour les internes de médecine générale, elle a beaucoup avancé. Cette page donne l’échéance selon votre situation, ce que les internes des promotions précédentes ont fait dans les faits, les étapes qui ne dépendent pas de vous, et un rétroplanning à adapter.
Les règles nationales citées ont été vérifiées à la date indiquée en bas de page. Les délais locaux — validation du sujet, réservation de salle, dépôt du manuscrit — varient d’une faculté à l’autre : ceux donnés ici sont des exemples datés, pas des normes. Le choix du sujet a son propre guide : Choisir son sujet de thèse.
La réponse courte
- La règle générale est de soutenir avant la fin de la phase d’approfondissement. C’est une condition pour entrer en phase de consolidation et devenir docteur junior — sauf, en médecine générale, pour les promotions 2023 à 2025 dont l’université a prolongé le délai.
- En médecine générale, le délai de trois ans après le DES a disparu pour les internes entrés depuis 2023. Sous l’ancienne règle, un sur cinq seulement soutenait pendant ses trois années d’internat.
- Ailleurs, la règle actuelle s’applique depuis 2017 : dans les promotions 2017 à 2019 retrouvées sur DUMAS, six thèses sur dix ont été soutenues dans les quatre mois précédant l’échéance.
- Les délais qui ne dépendent pas de vous — validation du sujet, avis d’un comité, réservation de salle, dépôt au moins quatre semaines avant — se comptent en mois. Ils se planifient en premier.
Votre date limite
| Votre situation | La thèse doit être soutenue |
|---|---|
| Toutes les autres spécialités | Avant la fin de la phase d’approfondissement |
| Médecine générale, entrée en internat avant la rentrée 2023 | Avant la fin de la phase d’approfondissement, ou au plus tard trois ans après sa validation, dans la limite de durée du troisième cycle |
| Médecine générale, entrée aux rentrées 2023, 2024 ou 2025 | Avant la fin de la phase d’approfondissement — sauf prolongation décidée par votre université jusqu’à la fin de la phase de consolidation |
| Médecine générale, entrée à partir de la rentrée 2026 | Avant la fin de la phase d’approfondissement |
En médecine générale, la phase d’approfondissement dure quatre semestres, après les deux de la phase socle : elle se termine à la fin de la troisième année, sauf si vous suivez une formation spécialisée transversale, qui la prolonge d’un an.
La prolongation des promotions 2023 à 2025 n’est pas un droit individuel. Le décret du 6 novembre 2025 la réserve aux universités qui rencontrent des difficultés matérielles pour organiser les soutenances, compte tenu du nombre de candidats. Le président de l’université la décide, sur proposition du directeur de l’UFR, et elle vaut alors pour tous les internes de médecine générale de cette UFR. Demandez à votre faculté, par écrit, si elle l’a adoptée. Dans une faculté qui l’a adoptée, les internes concernés sont nommés docteurs juniors sur la seule validation de la phase d’approfondissement, et soutiennent pendant la phase de consolidation.
Une dérogation individuelle existe, mais elle est exceptionnelle. Le président de l’université peut l’accorder, sur proposition du directeur de l’UFR, pour un motif dûment justifié. Elle ne se planifie pas.
Ne pas avoir soutenu à temps a des conséquences en chaîne. Sans thèse, pas de diplôme d’État de docteur, donc pas de phase de consolidation, hors prolongation accordée aux promotions 2023 à 2025 de médecine générale. L’interne qui a validé sa phase d’approfondissement sans avoir soutenu s’inscrit en « année de thèse ». Dans les spécialités où les stages de phase de consolidation se choisissent une fois par an, celui qui n’a pas soutenu avant le semestre de novembre participe à une nouvelle procédure de choix, au titre du semestre de mai. Et une autorisation de remplacement ne peut plus être délivrée au-delà de trois ans après la durée normale de votre DES, sauf report de soutenance attesté par votre UFR.
Une précaution : en 2026, certaines pages de facultés décrivaient encore la médecine générale comme un DES de trois ans. En cas de doute, c’est le texte national en vigueur qui fait foi.
Ce que les internes ont fait, dans les faits
Délai entre l’entrée en internat — le 1er novembre de l’année de la promotion — et la soutenance, pour les thèses retrouvées dans l’archive DUMAS.
| Internes | Médiane | Neuf sur dix avant | Soutenue dans les 3 premières années | Dans les 4 premières |
|---|---|---|---|---|
| Médecine générale, promotions 2014 à 2018 | environ 4 ans | 6 ans | 19 % | 45 % |
| Autres spécialités, promotions 2012 à 2016 | 4 ans et 7 mois | 5 ans et 7 mois | 1 % | 34 % |
| Autres spécialités, promotions 2017 à 2019 | 3 ans et 11 mois | 4 ans et 6 mois | 24 % | 81 % |
En médecine générale, l’ancienne règle a produit des soutenances tardives. Un an après la fin de leur DES de trois ans, la moitié des internes n’avaient pas encore soutenu. Neuf sur dix le faisaient avant six ans, le plafond de l’époque. Pour les internes entrés depuis 2023, la règle devient, hors prolongation, ce que faisait un sur cinq de leurs prédécesseurs — à peine plus d’un sur dix dans les promotions 2017 et 2018 : soutenir avant la fin de la troisième année. Le calendrier de vos aînés n’est donc plus un modèle.
Hors médecine générale, les promotions de la réforme de 2017 ont soutenu environ huit mois et demi plus tôt. La règle a aussi resserré les soutenances contre l’échéance : dans les promotions 2017 à 2019, six thèses sur dix ont été soutenues entre juillet et octobre de la troisième ou de la quatrième année d’internat, juste avant le changement de phase de novembre. À ce stade, un retard de quelques semaines retarde l’entrée en phase de consolidation.
Méthode. Source : les thèses d’exercice de médecine déposées sur DUMAS, l’archive ouverte des thèses et mémoires hébergée par HAL, interrogée le 27 septembre 2026. Une thèse est rattachée à une promotion du site seulement si le nom de l’auteur n’appartient qu’à une personne de la base, si la faculté de soutenance se trouve dans la subdivision d’affectation, et si la discipline concorde — médecine générale ou non. Le dépôt sur DUMAS dépend de chaque université, qui choisit ce qu’elle y verse : les chiffres portent sur les 10 subdivisions qui déposent régulièrement en indiquant la discipline (Aix-Marseille, Amiens, Antilles-Guyane, Bordeaux, Grenoble, Montpellier-Nîmes, Nice, Paris pour une partie de ses facultés, Poitiers, Rouen), soit 7 113 thèses pour les trois lignes du tableau ; les thèses sans discipline renseignée, surtout à Caen et à Clermont-Ferrand, sont écartées. Une thèse absente de DUMAS n’est pas une thèse non soutenue. Les promotions retenues sont assez anciennes pour que presque toutes les soutenances aient eu lieu ; la médiane de médecine générale varie de 4 ans à 4 ans et 5 mois quand on retire l’une ou l’autre des subdivisions, et d’environ 3 ans et demi à plus de 5 ans et demi d’une subdivision à l’autre, d’où l’arrondi.
Les étapes qui ne dépendent pas de vous
Une thèse, c’est surtout du travail personnel. Mais plusieurs étapes attendent la décision de quelqu’un d’autre, et ce sont elles qui font glisser les calendriers.
La validation du sujet. Au niveau national, le sujet est approuvé par le coordonnateur local de votre spécialité, inscrit dans votre contrat de formation, et choisi au plus tard avant la fin du deuxième semestre validé de la phase d’approfondissement. Des facultés ajoutent une étape. À Paris Cité, en médecine générale, l’avis favorable de la commission de thèse est requis avant tout projet. À Lyon, la validation de la fiche de thèse est obligatoire avant le recueil des données.
Les démarches réglementaires. Elles dépendent de votre projet, et le guide sur le choix du sujet aide à savoir lesquelles s’appliquent. Deux ordres de grandeur :
- un comité de protection des personnes, pour une recherche impliquant la personne humaine, rend son avis dans les 45 jours qui suivent la notification d’un dossier complet, et dans les 60 jours s’il pose des questions — le délai étant suspendu le temps des réponses du promoteur. Son silence vaut rejet ;
- un comité d’éthique de la recherche, souvent demandé pour publier même quand la loi ne l’impose pas, répond en général en trois mois selon le département de médecine générale de Paris Cité.
Le jury et la salle. La composition du jury se fait avec le directeur et selon les règles locales. La réservation de salle peut être le vrai goulot : Lille, qui organise plus de 550 soutenances par an, recommande de réserver plus de trois mois à l’avance, et déconseille juin, septembre et octobre, périodes surchargées.
Le dépôt. Paris Cité, Lyon et Lille demandent le dossier complet ou le manuscrit au moins quatre semaines avant la soutenance, avec parfois un contrôle anti-plagiat. À Lyon, les fermetures de décembre et d’août ne comptent pas dans ces quatre semaines : pour soutenir entre le 1er et le 5 septembre, le dossier doit être déposé avant le 20 juillet ; Paris Cité fixe le 23 juillet pour début septembre.
Un rétroplanning, à adapter
Exemple fictif : une interne de médecine générale entrée en novembre 2026. Sa phase d’approfondissement se termine début novembre 2029. Elle vise une soutenance au printemps 2029, pour garder plusieurs mois de marge. Les durées sont indicatives ; celles de votre faculté priment.
| Période | Étape | Ce qui peut bloquer |
|---|---|---|
| Nov. 2026 – août 2027 (phase socle) | Trouver une question, un directeur ; lire la littérature ; rédiger la fiche de thèse | Un directeur déjà surchargé |
| Sept. 2027 – févr. 2028 | Faire valider le sujet, puis démarches de protection des données et, si besoin, comité d’éthique ou CPP | Une commission qui ne siège pas avant plusieurs semaines ; un avis qui demande des modifications |
| Mars – juin 2028 | Recueil des données | Le recrutement des participants |
| Juil. – déc. 2028 | Analyse et rédaction | Les stages les plus prenants |
| Janv. – févr. 2029 | Relecture par le directeur, corrections ; jury constitué, salle réservée | Les délais de relecture, la réservation |
| Mars 2029 | Dépôt du manuscrit, au moins quatre semaines avant la soutenance | Une pièce manquante |
| Avril – mai 2029 | Soutenance | — |
| Juin – oct. 2029 | Marge | — |
Deux remarques sur cet exemple. D’abord, le travail lui-même ne commence vraiment qu’une fois le sujet validé : le département de médecine générale de Besançon parle de 12 à 18 mois de travail en moyenne, ce que le tableau respecte. Ensuite, la marge n’est pas du temps libre : c’est ce qui absorbe un avis de comité plus long que prévu, un recrutement difficile ou un stage épuisant.
Dans une autre spécialité, le squelette est le même. Seule change la date de fin de la phase d’approfondissement, qui dépend de votre maquette et, le cas échéant, d’une option ou d’une formation spécialisée transversale : lisez-les avant de fixer quoi que ce soit.
Le point mensuel
Dix minutes par mois, avec le rétroplanning sous les yeux :
- Quelle étape devait être terminée ce mois-ci, et l’est-elle ?
- Qu’est-ce que j’attends de quelqu’un d’autre, et depuis quand ?
- Mon directeur a-t-il eu de mes nouvelles ce mois-ci ?
- Que me reste-t-il de marge avant la date limite ?
- Mon prochain stage me laissera-t-il le temps prévu ?
- Faut-il avancer une réservation ou une demande dès maintenant ?
Si votre marge diminue deux mois de suite, le calendrier n’est plus réaliste : c’est le moment d’en parler au directeur, pas à la veille du dépôt.
Ce que cette page ne fait pas
Elle ne remplace ni votre faculté, ni votre département de médecine générale, ni votre coordonnateur : ce sont eux qui fixent les étapes et les délais locaux, et eux seuls qui peuvent vous répondre sur votre cas. Les chiffres décrivent ce qu’ont fait les promotions précédentes, dans les universités qui déposent sur DUMAS ; ils ne prédisent pas votre calendrier.
La suite
Cadrer son sujet de thèseSources
- Article R632-23 du code de l’éducation (version en vigueur depuis le 10 novembre 2025) — la thèse « se réfère à la spécialité suivie et porte sur un travail de recherche » ; elle est soutenue avant la fin de la phase d’approfondissement, sauf dérogation exceptionnelle du président de l’université pour un motif dûment justifié — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Décret n° 2025-1071 du 6 novembre 2025 — thèse avant la fin de la phase d’approfondissement ; médecine générale entrée avant la rentrée 2023 : jusqu’à trois ans après la validation de cette phase ; cohortes 2023, 2024 et 2025 : prolongation possible jusqu’à la fin de la phase de consolidation, décidée par le président de l’université en cas de difficultés matérielles d’organisation des soutenances ; les étudiants concernés sont alors nommés docteurs juniors sur la seule validation de la phase 2 (art. 2, al. 3) — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Arrêté du 12 avril 2017 portant organisation du troisième cycle des études de médecine — art. 13 (contrat de formation comprenant le sujet de thèse), art. 42, 59, 62 et 63 (thèse, phase de consolidation, année de thèse), art. 60 (sujet approuvé par le coordonnateur local, choisi avant la fin du deuxième semestre validé de la phase 2, jury d’au moins trois membres) — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Arrêté du 3 août 2023 — maquette du DES de médecine générale en quatre ans (phase socle de deux semestres, phase d’approfondissement de quatre semestres, phase de consolidation de deux semestres), applicable aux étudiants entrés à compter de la rentrée 2023 — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article R6153-1-1 du code de la santé publique — nomination comme docteur junior après validation de la phase d’approfondissement, soutenance de la thèse et obtention du diplôme d’État — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article D4131-2 du code de la santé publique — autorisations de remplacement des étudiants limitées dans le temps, sauf attestation d’un report de soutenance — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article R1123-23 du code de la santé publique — avis du comité de protection des personnes dans les 45 jours suivant la notification d’un dossier complet, 60 jours en cas de demande d’informations complémentaires ; le silence vaut rejet — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- DUMAS, archive ouverte des mémoires et thèses d’exercice — métadonnées des thèses d’exercice de médecine interrogées par l’API de HAL (type de diplôme, date de soutenance, faculté, discipline, titre, résumé) — CCSD (HAL), consulté le 27 septembre 2026.
- Thèse d’exercice — réservation auprès du bureau des thèses, pièces à déposer quatre semaines avant la soutenance — Université Paris Cité, UFR de médecine, consulté le 27 septembre 2026.
- Déclaration à la CNIL, CPP et comité d’éthique — avis d’un comité d’éthique de la recherche « généralement » en trois mois — Département de médecine générale, Université Paris Cité, consulté le 27 septembre 2026.
- Fiche de thèse — avis favorable de la commission de thèse requis avant tout projet — Département de médecine générale, Université Paris Cité, consulté le 27 septembre 2026.
- Instructions relatives aux thèses d’exercice de médecine (11 juillet 2025) — directeur, jury, réservation plus de trois mois avant, pièces au moins quatre semaines avant, dépôt sur PEPITE ; juin, septembre et octobre à éviter — Université de Lille, UFR3S, consulté le 27 septembre 2026.
- Procédure de soutenance de thèse de médecine 2026 (23 avril 2026) — dossier quatre semaines avant, fermetures de décembre et d’août, thèse à deux candidats au plus — Université Claude Bernard Lyon 1, consulté le 27 septembre 2026.
- Thèse de médecine, spécialité médecine générale — directeur non nécessairement médecin ni docteur, validation de la fiche avant le recueil, projets relevant de la recherche impliquant la personne humaine, liste des fiches validées depuis 2014 — Collège universitaire de médecine générale, Université Lyon 1, consulté le 27 septembre 2026.
- La thèse en médecine générale — jury, salle, permis d’imprimer ; « 12 à 18 mois de travail en moyenne » — Département de médecine générale de Besançon, consulté le 27 septembre 2026.
- Arrêté du 21 avril 2017, article 6 — une option ou une formation spécialisée transversale proroge d’un an la durée des DES de quatre ans au plus, et s’accomplit en phase d’approfondissement — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
- Article R632-19 du code de l’éducation — délai de validation de chaque phase, égal à deux fois sa durée réglementaire — Légifrance, consulté le 27 septembre 2026.
À lire ensuite
- Choisir son sujet de thèse : par où commencer ?Partir d’une question plutôt que d’un thème, vérifier données, cadre réglementaire, temps et encadrement — et ce que font les thèses récentes, d’après 9 000 résumés déposés sur DUMAS.
- Premier semestre d’internat : préparer son arrivéeLes démarches à faire avant de prendre ses fonctions, les interlocuteurs à identifier et les questions à poser les premiers jours. Organisation, pas protocole de soin.